Vid installation bör man ta hänsyn till några viktiga faktorer för att se till att systemet fungerar korrekt och säkert. Några saker att tänka på vid installation av solceller på båten är dels att placera solcellerna på en plats som får maximalt med solljus under dagen. Solcellerna bör monteras på ett ställe där dom inte blockeras av skuggor från master, bommar, segel eller andra föremål på båten. Om man t.ex skuggar 20% av solpanelens yta så försvinner upp till hela 60% av effekten och det beror på att spänningen ska ta sig igenom hela panelen och även genom de skuggade partierna. 

Se också till att solpanelen eller solpanelerna är ordentligt monterade på båten för att undvika skador eller förlust under gång. Solpaneler kan monteras direkt på däck eller på en särskild ställning. Se till att monteringslösningen blir stark och stabil. Om man limmar fast panelen på däck så är det viktigt att tvätta ytan noggrant först, applicera sedan en primer och limma med ett rekommenderat lim som t.ex sikaflex 591. Limmet bör man lägga i raka strängar med jämna mellanrum så regnvatten och fukt kan rinna under panelen. 

Kabeldragning ska göras med högkvalitativa kablar som är tillräckligt långa för att nå regulatorn och batteribanken, man bör också beräkna kabelarean och välja rätt dimension. Använd en lämplig kabelgenomföring för att skydda kabeln mot slitage om den behöver dras genom däck, kabeln ska inte heller utsättas för höga temperaturer. En regulator är en viktig del av solcellssystemet och hjälper till att skydda batterierna från överladdning och skador. En MPPT-regulator kan vara ett bättre alternativ än en PWM-regulator eftersom den kan ge högre effektivitet för solcellerna och hjälper till att hålla batterierna laddade under längre perioder.